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牙周病治療的費用組成主要依病情階段與所需處置而定，從健保補助項目到自費治療項目皆有清楚分類。初期若僅為輕度牙齦炎或牙周炎，基本洗牙、牙周檢查、X光診斷皆屬健保給付範圍，病患僅需負擔掛號費與部分負擔費，通常在數百元左右。

若牙周問題進展至中重度，例如牙周囊袋過深或牙根表面沈積大量牙結石，則需要接受牙根整平術（俗稱深層洗牙）。此療程需分區進行，健保最多補助兩次，每次需提出牙周病相關病歷與X光片佐證，經審查通過後可依規範施作，患者只需負擔基本費用。

但若牙齒已有明顯鬆動、骨吸收嚴重，則可能需要進行牙周翻瓣手術或骨再生療程。此類手術本身部分由健保負擔，但若涉及使用自費材料，如骨粉、再生膜或PRF等，費用需由病患自行支付，單次手術可能從五千至數萬元不等。

牙周治療後仍需定期進行牙周維護，每半年健保補助一次，包含局部牙結石清除與病灶追蹤。超出補助次數則需自費，費用依診所而異，約五百至一千元。了解健保補助與自費差異，有助做出符合自己需求與預算的治療選擇。

當牙周病進展至骨質被破壞，單靠清創已無法恢復牙齒穩定，此時可考慮牙周再生療法。引導組織再生（Guided Tissue Regeneration, GTR）是一種應用生物膜的技術，將可吸收或非吸收性膜片放置於牙根表面與牙肉之間，創造理想空間，阻隔牙肉細胞進入，讓牙周韌帶與骨細胞有機會重新生長。為加強修復，有時會搭配骨粉材料填補缺損部位。這些骨粉可能為異體骨、動物來源的骨質，或是人工合成材料，其作用在於提供骨細胞附著與增生的立體支架。術後幾週至數月內，人體會逐漸在此環境中進行骨重建與支持組織的修復，進而改善牙齒鬆動問題。這種技術特別適合用於垂直型骨缺損，或牙根分岔處的嚴重病灶。療效與病灶形狀、個人衛生習慣及術後照護密切相關，若能配合專業追蹤，則重建成功率大幅提升。